Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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