Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms