Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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