Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms