Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms