Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms