Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms