Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms