Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl17Q9CPR4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl17Q9CPR4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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