Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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