Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntnap4Q99P47 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntnap4Q99P47 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntnap4Q99P47 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntnap4Q99P47 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms