Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms