Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl3Q99N95 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl3Q99N95 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms