Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms