Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms