Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GatbQ99JT1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms