Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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