Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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