Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PpcsQ8VDG5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms