Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Top1mtQ8R4U6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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