Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms