Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms