Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsl1Q8K305 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nsl1Q8K305 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms