Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brd3Q8K2F0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1736.7 ms