Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 599.9 ms