Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrit1Q8K099 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrit1Q8K099 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrit1Q8K099 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrit1Q8K099 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrit1Q8K099 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms