Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkn3Q8K045 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkn3Q8K045 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms