Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Neurl3Q8CJC5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms