Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LgsnQ8CIX8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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