Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms