Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csnka2ipQ8CH19 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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