Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brf1Q8CFK2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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