Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms