Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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