Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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