Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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