Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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