Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nek11Q8C0Q4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nek11Q8C0Q4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nek11Q8C0Q4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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