Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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