Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slx1bQ8BX32 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx1bQ8BX32 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms