Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc30Q8BVF4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc30Q8BVF4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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