Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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