Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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