Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timd4Q6U7R4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Timd4Q6U7R4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Timd4Q6U7R4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Timd4Q6U7R4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Timd4Q6U7R4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Timd4Q6U7R4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms