Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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