Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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