Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms