Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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