Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Sbno1Q689Z5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno1Q689Z5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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