Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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